MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 87465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016112	GTT	2	6	294551	294556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403650
5502	NC_016112	GCC	2	6	294572	294577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403650
5503	NC_016112	GTT	2	6	294638	294643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403650
5504	NC_016112	ACG	2	6	294742	294747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403650
5505	NC_016112	GCT	2	6	294779	294784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403650
5506	NC_016112	GCG	2	6	294787	294792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403650
5507	NC_016112	TGC	2	6	294805	294810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403650
5508	NC_016112	TGC	2	6	294814	294819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403650
5509	NC_016112	ATC	2	6	294900	294905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403650
5510	NC_016112	GCT	2	6	294920	294925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403650
5511	NC_016112	CGC	2	6	294986	294991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403650
5512	NC_016112	GCG	2	6	295027	295032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403650
5513	NC_016112	TTC	2	6	295047	295052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403650
5514	NC_016112	GC	3	6	295119	295124	0 %	0 %	50 %	50 %	357403650
5515	NC_016112	GGC	2	6	295139	295144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403650
5516	NC_016112	GTT	2	6	295156	295161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403650
5517	NC_016112	CGGT	2	8	295186	295193	0 %	25 %	50 %	25 %	357403650
5518	NC_016112	GCA	2	6	295237	295242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403650
5519	NC_016112	CGT	2	6	295304	295309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403650
5520	NC_016112	GGT	2	6	295402	295407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403650
5521	NC_016112	TAG	2	6	295440	295445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_016112	GTAT	2	8	295653	295660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_016112	GACA	2	8	295691	295698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5524	NC_016112	TGCT	2	8	295704	295711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5525	NC_016112	TAT	2	6	295733	295738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403651
5526	NC_016112	CAT	2	6	295787	295792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403651
5527	NC_016112	AGA	2	6	296007	296012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403652
5528	NC_016112	TGT	2	6	296044	296049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403652
5529	NC_016112	ATTTT	2	10	296104	296113	20 %	80 %	0 %	0 %	357403652
5530	NC_016112	TGGCGA	2	12	296338	296349	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357403652
5531	NC_016112	TAT	2	6	296477	296482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403652
5532	NC_016112	TA	3	6	296552	296557	50 %	50 %	0 %	0 %	357403652
5533	NC_016112	GCCAG	2	10	296617	296626	20 %	0 %	40 %	40 %	357403652
5534	NC_016112	GCC	2	6	296788	296793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403652
5535	NC_016112	GCC	2	6	296893	296898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403652
5536	NC_016112	GCTAT	2	10	296931	296940	20 %	40 %	20 %	20 %	357403652
5537	NC_016112	TAT	2	6	296946	296951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403652
5538	NC_016112	GAT	2	6	296953	296958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403652
5539	NC_016112	GGT	2	6	297058	297063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403652
5540	NC_016112	CGC	2	6	297079	297084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403652
5541	NC_016112	CCGG	2	8	297197	297204	0 %	0 %	50 %	50 %	357403652
5542	NC_016112	CAT	2	6	297211	297216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403652
5543	NC_016112	CTT	2	6	297219	297224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403652
5544	NC_016112	ATT	2	6	297277	297282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403652
5545	NC_016112	TGCGG	2	10	297286	297295	0 %	20 %	60 %	20 %	357403652
5546	NC_016112	CGAGG	2	10	297296	297305	20 %	0 %	60 %	20 %	357403652
5547	NC_016112	GAT	2	6	297365	297370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403652
5548	NC_016112	GAG	2	6	297383	297388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403652
5549	NC_016112	G	6	6	297396	297401	0 %	0 %	100 %	0 %	357403652
5550	NC_016112	AAG	2	6	297450	297455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403652
5551	NC_016112	CAG	2	6	297497	297502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403652
5552	NC_016112	GC	3	6	297518	297523	0 %	0 %	50 %	50 %	357403652
5553	NC_016112	TCA	2	6	297582	297587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403652
5554	NC_016112	ATC	2	6	297681	297686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403652
5555	NC_016112	GGC	2	6	297688	297693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403652
5556	NC_016112	T	6	6	297698	297703	0 %	100 %	0 %	0 %	357403652
5557	NC_016112	CCG	2	6	297723	297728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403652
5558	NC_016112	CGG	2	6	297775	297780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403652
5559	NC_016112	TTG	2	6	297794	297799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403652
5560	NC_016112	TGGC	2	8	297812	297819	0 %	25 %	50 %	25 %	357403652
5561	NC_016112	GAT	2	6	297943	297948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403652
5562	NC_016112	GAA	2	6	297989	297994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403652
5563	NC_016112	TCAT	2	8	298004	298011	25 %	50 %	0 %	25 %	357403652
5564	NC_016112	TTG	2	6	298091	298096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403652
5565	NC_016112	AG	3	6	298111	298116	50 %	0 %	50 %	0 %	357403652
5566	NC_016112	TCG	2	6	298117	298122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403652
5567	NC_016112	TTCGGT	2	12	298139	298150	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	357403652
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5569	NC_016112	CAT	2	6	298225	298230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403652
5570	NC_016112	TGA	2	6	298351	298356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403652
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5573	NC_016112	GAG	2	6	298556	298561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403652
5574	NC_016112	ATC	2	6	298613	298618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403652
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5578	NC_016112	TCA	2	6	298843	298848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403652
5579	NC_016112	CAT	2	6	298915	298920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403652
5580	NC_016112	TAC	2	6	299004	299009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403652
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5589	NC_016112	GC	3	6	299701	299706	0 %	0 %	50 %	50 %	357403653
5590	NC_016112	ACATC	2	10	299760	299769	40 %	20 %	0 %	40 %	357403653
5591	NC_016112	GAT	2	6	299858	299863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403653
5592	NC_016112	CGC	2	6	299934	299939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403653
5593	NC_016112	CTG	2	6	299957	299962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403653
5594	NC_016112	TGT	2	6	299967	299972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403653
5595	NC_016112	GCGATA	2	12	300003	300014	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	357403653
5596	NC_016112	CGA	2	6	300037	300042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403653
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5598	NC_016112	GGCGTC	2	12	300122	300133	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357403653
5599	NC_016112	GCCG	2	8	300223	300230	0 %	0 %	50 %	50 %	357403653
5600	NC_016112	GCC	2	6	300385	300390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403653
5601	NC_016112	CAG	2	6	300521	300526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403653
5602	NC_016112	CG	4	8	300544	300551	0 %	0 %	50 %	50 %	357403653
5603	NC_016112	GCC	2	6	300654	300659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403653
5604	NC_016112	CAT	2	6	300673	300678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403653
5605	NC_016112	CGG	2	6	300691	300696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403653
5606	NC_016112	ACG	2	6	300841	300846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_016112	TGG	2	6	301050	301055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_016112	CGG	2	6	301112	301117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_016112	GCC	2	6	301126	301131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5610	NC_016112	GTCG	2	8	301139	301146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_016112	TCG	2	6	301261	301266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_016112	TTC	2	6	301304	301309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_016112	GC	3	6	301352	301357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_016112	TCA	2	6	301438	301443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403654
5615	NC_016112	CGA	2	6	301483	301488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403654
5616	NC_016112	GC	5	10	301502	301511	0 %	0 %	50 %	50 %	357403654
5617	NC_016112	GT	3	6	301626	301631	0 %	50 %	50 %	0 %	357403654
5618	NC_016112	CCG	2	6	301632	301637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403654
5619	NC_016112	GCC	2	6	301704	301709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403654
5620	NC_016112	CG	3	6	301719	301724	0 %	0 %	50 %	50 %	357403654
5621	NC_016112	ATG	3	9	301790	301798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403654
5622	NC_016112	GC	3	6	301812	301817	0 %	0 %	50 %	50 %	357403654
5623	NC_016112	TCGAT	2	10	301881	301890	20 %	40 %	20 %	20 %	357403654
5624	NC_016112	AGT	2	6	301926	301931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403654
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5629	NC_016112	TGA	2	6	302228	302233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403655
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5637	NC_016112	TTA	2	6	302619	302624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5731	NC_016112	GTA	2	6	308075	308080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5738	NC_016112	TTTCT	2	10	308360	308369	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5739	NC_016112	AT	3	6	308461	308466	50 %	50 %	0 %	0 %	357403660
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5999	NC_016112	CGA	2	6	321137	321142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403677
6000	NC_016112	ATG	3	9	321144	321152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403677

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